ГЛАВА 13

June 9, 2024
0
0
Зміст

БИОЛОГИЧЕСКИ ВАЖНЫЕ ГЕТЕРОЦИКЛИЧЕСКИЕ СОЕДИНЕНИЯ. НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ. НУКЛЕОТИДНЫЕ КОФЕРМЕНТЫ

 

 

Общая характеристика. Классификация.

Гетероциклическими называют циклические органические соединения, в состав цикла которых, помимо атомов углерода, входят один или несколько атомов других элементов (гетероатомов).

Гетероциклические соединения очень разнообразны. Их классифицируют согласно следующим структурным признакам:

•  природа гетероатома;

•  число гетероатомов;

•  размер цикла;

•  степень насыщенности.

В зависимости от природы гетероатома различают, в частности, азот-, кислород-, серосодержащие гетероциклические соединения. Гетероциклы с этими гетероатомами наиболее важны в связи с их биологической ролью.

По числу гетероатомов гетероциклические соединения подразделяют на гетероциклы с одним, двумя и т. д. гетероатомами. При этом гетероатомы могут быть как одинаковыми, так и разными.

Размер цикла может быть различным, начиная с трехчленного. Наибольшее распространение в природе имеют пяти- и шестичленные циклы, содержащие в качестве гетероатомов азот, кислород, серу. В таких соединениях валентные углы между атомами в цикле существенно не отличаются от обычных валентных углов sp3или sр2-гибридизованного атома углерода. Причина этого заключается в одинаковой гибридизации атомов С, N, О, S и сравнительно небольших размерах указанных атомов, близких по размеру к группе СН2, поэтому замена группировки Н2– или -СН= в цикле на такой гетероатом практически не изменяет геометрию молекулы.

Гетероциклы могут быть ароматическими, насыщенными и ненасыщенными.

Ароматические гетероциклы – самые распространенные в природе, поэтому им уделено основное внимание в данной главе. Наиболее важные гетероциклы, составляющие основу многих природных биологически активных веществ и лекарственных средств.

Насыщенные гетероциклы, например приведенные ниже, представляют собой циклические простые эфиры или вторичные амины с циклическим скелетом.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_007.png

Ненасыщенные гетероциклы (кроме ароматических) часто неустойчивы и встречаются, как правило, в виде производных. Кислородсодержащий гетероцикл α-пиран вообще не известен, так как термодинамически неустойчив.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_009.png

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_005.jpeg

 

Номенклатура

Названия ароматических гетероциклов, как правило, тривиальные, и они приняты номенклатурой ИЮПАК.

В моноциклических соединениях нумерация атомов всегда начинается от гетероатома (примеры нумерации приведены выше). В гетероциклах с несколькими одинаковыми гетероатомами эти атомы получают наименьшие номера. Если имеются два атома азота с различным электронным строением (-N= и -NH-), то нумерацию ведут от фрагмента -NH-, как показано на примерах пиразола и имидазола. В гетероциклах с разными гетероатомами старшим считается кислород, далее сера и затем азот.

В конденсированных гетероциклах нумерацию ведут от одной из вершин бициклической структуры так, чтобы гетероатом получил наименьший номер (см. примеры хинолина и изохинолина). Однако имеются исключения из этого правила, как, например, пурин, для которого сохранена исторически сложившаяся нумерация.

Производные гетероциклов называют по общим правилам заместительной номенклатуры, где в качестве названий родоначальных структур приняты тривиальные названия гетероциклов. В приведенных примерах в скобках указаны также тривиальные названия некоторых производных.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_016.jpeg

 

Реакционная способность ароматических гетероциклов

Ароматические свойства

Пиридин по электронному строению напоминает бензол. Все атомы углерода и атом азота находятся в состоянии sp2-гибридизации, и все σ-связи (C-C, C-N и C-H) лежат в одной плоскости. Из трех гибридных орбиталей атома азота две участвуют в образовании σ-связей с атомами углерода (показаны только оси этих орбиталей), а третья орбиталь содержит неподеленную пару электронов и в образовании связи не участвует. Атом азота с такой электронной конфигурацией называют пиридиновым.

 

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_026.jpeg

За счет электрона, находящегося на негибридизованной р-орбитали, атом азота участвует в образовании единого электронного облака sр-электронами пяти атомов углерода. Таким образом, пиридин является π,π-сопряженной системой и удовлетворяет критериям ароматичности.

В результате большей электроотрицательности по сравнению с атомом углерода пиридиновый атом азота понижает электронную плотность на атомах углерода ароматического кольца, поэтому системы с пиридиновым атомом азота называют π-недостаточными. Кроме пиридина, примером таких систем служит пиримидин, содержащий два пиридиновых атома азота.

Пиррол также относится к ароматическим соединениям. Атомы углерода и азота в нем, как и в пиридине, находятся в состоянии sp2-гибридизации. Однако в отличие от пиридина атом азота в пирроле имеет иную электронную конфигурацию.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_010.png

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_015.jpeg

На негибридизованной  рорбитали атома азота находится неподеленная пара электронов. Она участвует в сопряжении с р-электрона- ми четырех атомов углерода с образованием единого шестиэлектронного облака. Три sp2-гибридные орбитали образуют три σ-связи – две с атомами углерода, одну с атомом водорода. Атом азота в таком электронном состоянии получил название пиррольного.

Шестиэлектронное облако в пирроле благодаря р,πсопряжению делокализовано на пяти атомах цикла, поэтому пиррол представляет собой π-избыточную систему.

В фуране и тиофене ароматический секстет также включает неподеленную пару электронов негибридизованной p-АО кислорода или серы соответственно. В имидазоле и пиразоле два атома азота вносят разный вклад в образование делокализованного электронного облака: пиррольный атом азота поставляет пару и-электронов, а пиридиновый – один p-электрон.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_036.jpeg

Ароматичностью обладает также пурин, представляющий собой конденсированную систему двух гетероциклов – пиримидина и имидазола.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_020.jpeg

Делокализованное электронное облако в пурине включает 8 π-электронов двойных связей и неподеленную пару электронов атома N-9. Общее число электронов в сопряжении, равное десяти, соответствует формуле Хюккеля (4n + 2, где п = 2).

Гетероциклические ароматические соединения обладают высокой термодинамической устойчивостью. Неудивительно, что именно они служат структурными единицами важнейших биополимеров – нуклеиновых кислот.

 

Кислотно-основные и нуклеофильные свойства

Основные свойства гетероциклических соединений обусловлены неподеленной парой электронов гетероатома, способной присоединять протон. Такими свойствами обладает пиридиновый атом азота, у которого n-электроны находятся на sp2-гибридной орбитали и не вступают в сопряжение. Пиридин является основанием и с сильными кислотами образует пиридиниевые соли, подобные аммониевым солям.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_030.jpeg

Аналогично основные свойства проявляют и другие гетероциклы, содержащие пиридиновый атом азота. Так, имидазол и пиразол образуют соли с минеральными кислотами за счет пиридинового атома азота.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_006.png

Пиррольный атом азота в молекулах имидазола, пиразола и, естественно, самого пиррола не склонен связывать протон, так как его неподеленная пара электронов является частью ароматического секстета. В результате пиррол практически лишен основных свойств.

В то же время пиррольный атом азота может служить центром кислотности. Пиррол ведет себя, как слабая NH-кислота, поэтому протон будет отщепляться только при действии очень сильных оснований, например амида натрия NaNH2 или гидрида натрия NaH. За счет пиррольного атома азота в реакциях со щелочными металлами также образуются соли, которые легко гидролизуются.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_010.jpeg

Таким образом, имидазол и пиразол могут проявлять как основные, так и кислотные свойства, т. е. являются амфотерными соединениями.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_004.jpeg

Гетероциклы, содержащие пиридиновый атом азота, проявляют и нуклеофильные свойства, т. е. способность атаковать атом углерода, несущий частичный положительный заряд (электрофильный центр). Так, взаимодействие пиридина с галогеноалканами приводит к образованию алкилпиридиниевых солей.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_023.jpeg

 

Особенности реакций электрофильного замещения

Пиррол и фуран относятся к π-избыточным системам. У них легче протекают реакции электрофильного замещения по сравнению с бензолом. Следует, однако, учитывать, что сильные кислоты, часто применяемые при электрофильном замещении, атакуют атомы углерода

π-избыточных гетероциклов, что приводит к образованию смесей полимерных продуктов, не имеющих практического применения. Способность гетероциклических соединений подвергаться глубоким превращениям под действием кислот называют ацидофобностью (боязнью кислот), а сами гетероциклыацидофобными.

Пиридин и другие гетероциклы с пиридиновым атомом азота являются электронодефицитными. Они гораздо труднее, чем бензол, вступают в реакции электрофильного замещения, а некоторые реакции (например, алкилирование по атомам углерода кольца) не идут вовсе. Низкая реакционная способность пиридина обусловлена еще и тем, что в сильнокислых средах, в которых осуществляется электрофильное замещение, пиридин находится в протонированной форме в виде катиона пиридиния C5H5NH+, что существенно затрудняет электрофильную атаку.

 

ПЯТИЧЛЕННЫЕ ГЕТЕРОЦИКЛЫ

Гетероциклы с одним гетероатомом

Важнейшим представителем пятичленных гетероциклов с одним гетероатомом является пиррол. Видимо, неслучайно сам пиррол был первым гетероциклическим соединением, выделенным из природных источников еще в 1834 г. К пиррольным соединениям относят конденсированную систему индола и полностью насыщенный аналог пиррола – пирролидин, которые входят в состав сложных по структуре молекул хлорофиллов, гема крови и алкалои дов, например никотина и тропана. Так, в основе структуры гема и хлорофиллов лежит  тетрапиррольная система порфина.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_006.jpeg

Индол. По химическим свойствам эта ароматическая система очень напоминает пиррол. Индол также ацидофобен и практически лишен основных свойств. При взаимодействии с сильными основаниями ведет себя, как слабая NH-кислота.

Индол является структурным фрагментом белковой аминокислоты триптофана и продуктов его метаболических превращений – триптамина и серотонина, относящихся к биогенным аминам, а также (индол-3-илксусной кислоты (гетероауксина).

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_002.png

Гетероауксин в растительном мире является гормоном роста и применяется в сельском хозяйстве для стимуляции роста растений.

Немало синтетических производных индола применяется в медицине. Примером таких соединений может служить антидепрессант индопан.

Фуран. Соединения фуранового ряда не обнаружены в продуктах метаболизма животных организмов, но они встречаются в растительном мире. Известны многие лекарственные средства, содержащие фурановое ядро, часто в комбинации с другими гетероциклами. Примерами служат противомикробные препараты фурацилин и фуразолидон.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_014.png

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4.jpeg

Гетероциклы с двумя гетероатомами

Пятичленные гетероциклы с двумя гетероатомами, один из которых азот, имеют общее название азолы. Важнейшими из них являются имидазол, пиразол и тиазол. Эти соединения, в отличие от пятичленных гетероциклов с одним гетероатомом, не разрушаются при действии кислот (т. е. неацидофобны), а образуют с ними соли.

Имидазол. Этот гетероцикл является структурным фрагментом белковой аминокислоты гистидина и продукта ее декарбоксилирования – биогенного амина гистамина.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_019.jpeg

Имидазол, конденсированный с бензольным кольцом – бензимидазол – входит в состав ряда природных веществ, в частности витамина В12, а также вазодилатирующего средства дибазола (2-бен- зилбензимидазола).

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_022.jpeg

Пиразол. Производные пиразола в природе не обнаружены. Наиболее известным производным пиразола является пиразолон, одна из изомерных форм которого приведена ниже. На основе пиразолона созданы анальгетические средства – анальгин, бутадион и др.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_011.png

Тиазол. В цикле тиазола содержатся два разных гетероатома. Структура тиазола встречается в составе важных биологически активных веществ – тиамина (витамина В1) и ряде сульфаниламидных препаратов, например, противомикробного средства фталазола.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_018.jpeg

Цикл полностью гидрированного тиазолатиазолидин – является структурным фрагментом пенициллиновых антибиотиков.

 

ШЕСТИЧЛЕННЫЕ ГЕТЕРОЦИКЛЫ

Гетероциклы с одним гетероатомом

Пиридин. Этот наиболее типичный представитель ароматических гетероциклов проявляет большинство химических свойств ароматических соединений: легче вступает в реакции замещения, чем присоединения; его атомы углерода устойчивы к действию окислителей. Он термодинамически устойчив.

В то же время гомологи пиридина (аналогично гомологам бензола) легко окисляются в соответствующие пиридинкарбоновые кислоты. Важное значение имеет окисление изомерных метилпиридинов. Так, 3-метилпиридин превращается в никотиновую кислоту, а его 4-изо- мер – в изоникотиновую (пиридин-4-карбоновую) кислоту.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_007.jpeg

Кстати, никотиновая кислота получила свое название оттого, что была получена при окислении никотина.

Как уже говорилось, пиридин проявляет основные свойства; его основность несколько выше, чем ароматических аминов (например, анилина), но значительно ниже, чем алифатических аминов. Это связано с тем, что неподеленная пара электронов атома азота занимает sp2-гибридную орбиталь. Атом азота в пиридине более электроотрицателен, чем sp3-гибридизованный атом азота в алифатических аминах, и, следовательно, прочнее удерживает свою электронную пару.

Благодаря пониженной электронной плотности на атомах углерода кольца пиридин может вступать в не характерные для бензола реакции с нуклеофильными реагентами. Наиболее восприимчиво к нуклеофильной атаке кольцо алкилпиридиниевого иона, где электронная плотность на атомах углерода особенно понижена. Так, алкилпиридиниевые соли способны восстанавливаться комплексными гидридами металлов в частично насыщенное производное пиридина, как упрощенно показано ниже.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_008.jpeg

В 1,4-дигидро-N-метилпиридине ароматичность нарушена, поэтому его молекула обладает большим запасом энергии и стремится путем обратной реакции окисления вновь перейти в ароматическое состояние. Эти реакции окисления-восстановления моделируют действие важного кофермента НАД+, в состав которого входит замещенный катион пиридиния.

Структура полностью насыщенного пиридина – пиперидина – лежит в основе анальгетика промедола.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_012.png

Важными производными пиридина являются некоторые витамины группы В, выступающие в роли структурных элементов коферментов. Ниже приведены различные формы витамина В6, участвующие в виде фосфатов в реакции биосинтеза α-аминокислот.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_027.jpeg

 

Никотиновая и изоникотиновая кислоты и их производные. Никотиновая кислота и ее амидникотинамид – известны как две формы витамина РР. Никотинамид является составной частью ферментных систем, ответственных за окислительно-восстановительные процессы в организме, а диэтиламид никотиновой кислоты – кордиамин – служит эффективным стимулятором ЦНС.

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_013.jpeg

На основе изоникотиновой кислоты синтезированы противотуберкулезные средства изониазид (тубазид) – гидразид этой кислоты и его производное фтивазид.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4.png

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_031.jpeg

Хинолин и изохинолин. Эти конденсированные системы по свойствам подобны пиридину: проявляют основные свойства, способны образовывать четвертичные соли.

Ядро хинолина входит в состав противомикробного средства нитроксолина (5-НОК).

 

Гетероциклы с двумя гетероатомами

В этой группе наиболее важными являются гетероциклы, содержащие два атома азота. Они имеют общее название диазины и различаются взаимным расположением атомов азота.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_003.jpeg

Эти гетероциклы содержат атомы азота пиридинового типа, поэтому каждый из диазинов представляет собой шестиэлектронную ароматическую систему. Введение второго атома азота в шестичленное кольцо еще больше понижает активность гетероциклического ядра (по сравнению с пиридином) в реакциях электрофильного замещения.

Основность диазинов значительно (на 3-4 порядка) ниже, чем пиридина, поскольку один атом азота выступает в роли электроноакцептора по отношению к другому. Диазины образуют соли только с одним эквивалентом сильной кислоты.

Среди производных диазинов, имеющих биологическое значение и применяемых в медицине, наиболее важны гидрокси и аминопроизводные пиримидина.

Для 2-гидроксипроизводных гетероциклов, содержащих фрагмент -N=C-OH, типична лактим-лактамная таутомерия как частный случай прототропной таутомерии. Взаимопревращение тауто мерных форм связано с переносом протона от гидроксильной группы, напоминающей фенольную группу ОН, к основному центру – пиридиновому атому азота и обратно. В полярных растворителях и в кристаллическом состоянии лактамные формы явно преобладают, что связано с большим сродством к протону атома азота, нежели атома кислорода.

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_011.jpeg

Три пиримидиновых основания – урацил (2,4-дигидроксипи- римидин), тимин (2,4-дигидрокси-5-метилпиримидин) и цитозин (4-амино-2-гидроксипиримидин) – являются компонентами нуклеотидов и нуклеиновых кислот. Пиримидиновые основания существуют практически только в лактамной форме (лактамный фрагмент выделен цветной рамкой, лактимный – черной).

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_014.jpeg

Очевидно, что в лактимной форме, т. е. гидроксиформе, пиримидиновое ядро ароматично. Однако и в лактамной форме ароматичность не нарушена, так как ароматическая система образована в результате участия в сопряжении неподеленной пары электронов «амидного» атома азота. Разрыв сопряжения в кольце отсутствует.

К производным пиримидина относится барбитуровая кислота (2,4,6-тригидроксипиримидин), которая может существовать в несколь ких таутомерных формах, три из которых приведены ниже. Структуры (I) и (II) представляют соответственно лактимный и лактамный таутомеры, а структуры (II) и (III) – енольный и кетонный таутомеры. В кристаллическом состоянии барбитуровая кислота имеет строение триоксопроизводного (III), которое преобладает и в растворе.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_024.jpeg

Барбитуровая кислота легко образует соли при действии щелочей. Ее весьма высокая кислотность (pKa 3,9) обусловлена эффективной делокализацией отрицательного заряда в барбитурат-ионе с участием двух атомов кислорода.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_028.jpeg

Широкое применение в медицине нашли барбитураты – производные барбитуровой кислоты, у которых в положении 5 находятся два (реже – один) углеводородных заместителя. С начала ХХ в. в качестве снотворных средств использовались барбитал (веронал), фенобарбитал (люминал). Последний применяют в настоящее время как противоэпилептическое средство.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_003.png

Барбитураты также обладают определенной кислотностью (например, pKa барбитала равен 7,9). Некоторые из них применяются в виде натриевых солей, например барбитал-натрий, что обусловлено хорошей растворимостью таких солей в воде.

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_021.jpeg

Представителем шестичленных гетероциклических соединений с двумя различными гетероатомами (азота и серы) служит фенотиазин.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_017.jpeg

Важное значение имеют 2,10-дизамещенные производные фенотиазина, составляющие большую группу лекарственных средств психотропного действия. Один из них – аминазин – широко применяется как антипсихотическое средство.

 

Конденсированные гетероциклы

Из систем с двумя конденсированными гетероциклами важное значение имеют соединения пуринового ряда, в частности гидроксипурины и аминопурины, принимающие активное участие в процессах жизнедеятельности.

Гидроксипурины

Гипоксантин (6-гидроксипурин), ксантин (2,6-дигидроксипурин) и мочевая кислота (2,6,8-тригидроксипурин) образуются в организме при метаболизме нуклеиновых кислот. Ниже они изображены в лактамной форме, в которой находятся в кристаллическом состоянии.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_005.png

У гидроксипуринов возможна как лактим-лактамная таутомерия, так и таутомерия азолов, связанная с миграцией атома водорода от атома N-7 к N-9, как показано на примере гипоксантина.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_004.png

Мочевая кислота – конечный продукт метаболизма пуриновых соединений в организме. Она выделяется с мочой в количестве 0,5-1 г/сут. Мочевая кислота двухосновна, плохо растворима в воде, но легко растворяется в щелочах, образуя соли с одним или двумя эквивалентами щелочи (приведено вероятное строение солей).

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_015.png

Соли мочевой кислоты называют уратами. При некоторых нарушениях в организме они откладываются в суставах, например при подагре, а также в виде почечных камней.

Ксантин и гипоксантин по химическому поведению во многом аналогичны мочевой кислоте. Они амфотерны и образуют соли с кислотами и щелочами.

Метилированные в различной степени по атомам азота производные ксантина обычно относят к алкалоидам. Это кофеин (1,3,7-триметилксантин), теофиллин (1,3-диметилксантин) и теобромин (3,7-диметилксантин). Их природными источниками служат листья чая, зерна кофе, бобы какао.

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_009.jpeg

Кофеин – эффективный возбудитель ЦНС, он стимулирует работу сердца. Общестимулирующее действие теофиллина и теобромина выражено меньше, но они обладают довольно сильными мочегонными свойствами.

 

Аминопурины

Из аминопуринов наиболее важны аденин (6-аминопурин) и гуанин (2-амино-6-гидроксипурин), являющиеся структурными фрагмента- ми нуклеиновых кислот. Аденин также входит в состав некоторых коферментов. Преобладающей таутомерной формой гуанина является лактамная. Для обоих соединений возможна и таутомерия азолов в результате миграции атома водорода между атомами N-7 и N-9.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_013.png

При действии на аденин азотистой кислоты HNO2 происходит его дезаминирование с образованием гипоксантина. Аналогичная реакция в случае гуанина приводит к ксантину.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_029.jpeg

 

 

АЛКАЛОИДЫ

Алкалоидами называют основные азотсодержащие вещества природного (главным образом растительного) происхождения.

Благодаря высокой фармакологической активности алкалоиды известны с давних времен и используются в медицине. Хрестоматийным примером служит применение с середины XVII в. хинина, выделяемого из коры хинного дерева, для лечения малярии.

Почти все алкалоиды имеют в структуре атом азота. Это обусловливает основные свойства алкалоидов, что нашло отражение в их групповом названии (от араб. al-qali – щелочь). В растениях алкалоиды содержатся в виде солей органических кислот – лимонной, яблочной, щавелевой и др.

Важнейшим структурным фрагментом большинства алкалоидов служит какой-либо азотсодержащий гетероцикл. Этот признак положен в основу химической классификации алкалоидов, по которой они подразделяются на группы в соответствии с типом гетероцикла в их структуре, например пиридина, хинолина и т. д. Такие алкалоиды имеют единство в биогенетическом происхождении от аминокислот, их называют истинными алкалоидами.

Наряду с этим существуют алкалоиды, у которых атом азота не включен в гетероциклическую структуру. Эти алкалоиды представляют собой растительные амины, их относят к протоалкалоидам.

При большом разнообразии структур алкалоидов в качестве общего химического свойства можно выделить реакции солеобразования. Эти реакции используют в двух направлениях:

•  для получения хорошо растворимых в воде солей, например, с минеральными кислотами (хлориды, ацетаты);

•  для получения окрашенных солей с ограниченной растворимостью (с органическими и неорганическими кислотами).

Первое направление используется главным образом для извлечения алкалоидов из природных источников, второе – в аналитических целях для качественного обнаружения алкалоидов.

 

Алкалоиды группы пирролидина, пиридина и пиперидина

Никотин – весьма токсичный алкалоид, содержание которого в листьях табака доходит до 8%. Включает связанные простой связью

ядра пиридина и пирролидина. Воздействует на вегетативную нервную систему, сужает кровеносные сосуды.

Никотиновая кислота (одна из форм витамина РР) является одним из продуктов окисления никотина и используется для синтеза других препаратов.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_035.jpeg

Лобелин и родственные ему алкалоиды обнаружены в североамериканском растении лобелия. Они близки по структуре и используются в медицине в качестве эффективных рефлекторных стимуляторов дыхания.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_025.jpeg

 

Алкалоиды группы тропана

Базовая структура алкалоидов этой группы – тропан – является бициклическим соединением, в состав которого входят пирролидиновое и пиперидиновое кольца.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_002.jpeg

К тропановым алкалоидам относятся атропин и кокаин, применяемые в медицине как холиноблокаторы.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_033.jpeg

Атропин содержится в растениях семейства пасленовых: красавке, белене, дурмане. Несмотря на высокую токсичность, он широко применяется в глазной практике, благодаря способности расширять зрачок.

Кокаин – основной алкалоид южноамериканского кустарника Erythroxylon coca Lam. Это одно из первых используемых в медицине анестезирующих и наркотических средств. Синтетические аналоги кокаина, лишенные наркотических свойств, являются производными п-аминобензойной кислоты.

 

Алкалоиды группы хинолина и изохинолина

Наибольшую известность из хинолиновых алкалоидов получил хинин, выделенный из коры хинного дерева. В состав хинина входят две гетероциклические системы – хинолиновая и хинуклидиновая.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_034.jpeg

Хинин используется в медицине более 300 лет в качестве противомалярийного средства. В настоящее время из-за ряда негативных побочных эффектов его использование сократилось и на смену ему пришли новые синтетические противомалярийные препараты.

Ядро изохинолина содержится в алкалоидах опия, представляющего собой высохший млечный сок незрелых коробочек мака опийного. Основной из них – морфин – обладает сильным обезболивающим свойством, но при длительном употреблении вызывает привыкание. Морфин был первым алкалоидом, выделенным в чистом виде (1806) и был назван по имени бога сна и сновидений Морфея.

Монометиловый эфир морфина – кодеин – оказывает противокашлевое действие, а диацетильное производное – героин – наркотик.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_012.jpeg

Другим алкалоидом группы изохинолина, также выделенным изопия, служит папаверин, применяемый в качестве эффективного спазмолитического средства. Синтетический аналог папаверина ношпа имеет с ним явное структурное сходство.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_032.jpeg

 

Протоалкалоиды

В эту группу алкалоидов входят растительные основания, не имеющие в своей структуре какого-либо гетероцикла. Важнейшим их представителем является эфедрин, выделяемый из различных видов эфедры.

В молекуле эфедрина содержатся два хиральных центра, в соответствии с этим эфедрин существует в виде четырех стереоизомеров и двух рацематов. Наибольшей фармакологической активностью обладает природный эфедрин, являющийся одним из стереизомеров.

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/14_files/mb4_008.png

По химической структуре эфедрин подобен катехоламинам.

 

 

НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ. НУКЛЕОТИДНЫЕ КОФЕРМЕНТЫ

Нуклеиновые кислоты представляют собой высокомолекулярные соединения, молекулярная масса которых колеблется от 25 тыс. до 1 млн и более.

Полимерные цепи нуклеиновых кислот построены из мономерных единиц – нуклеотидов, в связи с чем нуклеиновые кислоты назы вают полинуклеотидами.

Обычно «неделимое» мономерное звено (например, аминокислотный остаток в белках) у нуклеотидов представляет собой трехкомпонентное образование, включающее гетероциклическое основание, углеводный остаток и фосфатную группу.

Углеводными компонентами служат пентозы – D-рибоза и 2-дезоксирибоза. В зависимости от этого нуклеиновые кислоты делятся на рибонуклеиновые (РНК), содержащие рибозу, и дезоксирибонуклеиновые (ДНК), содержащие дезоксирибозу.

ДНК содержатся в основном в ядрах клеток, РНК находятся преимущественно в рибосомах, а также протоплазме клеток. РНК непосредственно участвуют в биосинтезе белка.

Нуклеозиды

В химии нуклеиновых кислот входящие в их состав гетероциклические соединения пиримидинового и пуринового рядов обычно называют нуклеиновыми основаниями.

Нуклеиновые основания в качестве заместителей в гетероцикле могут содержать:

•  либо оксогруппу, как в урациле и тимине;

•  либо аминогруппу, как в аденине;

•  либо одновременно обе эти группы, как в цитозине и гуанине.

Кислородсодержащие основания представлены лактамными таутомерными формами, в которых ароматичность не нарушена. Для всех оснований приняты сокращенные трехбуквенные обозначения, составленные из первых букв их латинских названий.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_004.jpeg

Нуклеиновые кислоты различаются входящими в них гетероциклическими основаниями: урацил входит только в РНК, а тимин

в ДНК:

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_002.png

Нуклеиновые основания образуют связь за счет одного из атомов азота с аномерным центром пентозы (D-рибозы или 2-дезокси-D- рибозы). Этот тип связи аналогичен обычной гликозидной связи и известен как N-гликозидная связь, а сами гликозиды – как N-гликозиды. В химии нуклеиновых кислот их называют нуклеозидами.

В состав природных нуклеозидов пентозы входят в фуранозной форме (атомы углерода в них нумеруют цифрой со штрихом). Гликозидная связь осуществляется с атомом азота N-1 пиримидинового и N-9 пуринового оснований.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_005.jpeg

Природные нуклеозиды всегда являются β-аномерами.

В зависимости от природы углеводного остатка различают рибонуклеозиды и дезоксирибонуклеозиды. Для нуклеозидов употребительны названия, производимые от тривиального названия соответствующего нуклеинового основания с суффиксами идин у пиримидиновых и озин у пуриновых нуклеозидов.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_006.png

Исключение составляет название «тимидин» (а не дезокситимидин), используемое для дезоксирибозида тимина, входящего в состав ДНК. В тех редких случаях, когда тимин встречается в РНК, соответствующий нуклеозид называется риботимидином.

Трехбуквенные символы нуклеозидов отличаются от символов оснований последней буквой. Однобуквенные символы применяются только для остатков (радикалов) нуклеозидов в более сложных структурах.

Нуклеозиды устойчивы к гидролизу в слабощелочной среде, но гидролизуются в кислой. Пуриновые нуклеозиды гидролизуются легко, пиримидиновые труднее.

В качестве лекарственных средств в онкологии используют синтетические производные пиримидинового и пуринового рядов, по строению похожие на естественные метаболиты (в данном случае – на нуклеиновые основания), но не полностью им идентичные, т. е. являющиеся антиметаболитами. Например, 5-фторурацил выступает

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_014.jpeg

в роли антагониста урацила и тимина, 6-меркаптопурин аденина. Конкурируя с метаболитами, они нарушают синтез нуклеиновых кислот в организме на разных этапах.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4.jpeg

 

 

Нуклеотиды

Нуклеотидами называют фосфаты нуклеозидов. Фосфорная кислота обычно этерифицирует спиртовый гидроксил при С-5′ или С-3′ в остатке рибозы (рибонуклеотиды) или дезоксирибозы (дезоксирибонуклеотиды).

Общий принцип строения нуклеотидов показан на примере фосфатов аденозина. Для связывания трех компонентов в молекуле нуклеотида используются сложноэфирная и N-гликозидная связи.

Нуклеотиды можно рассматривать, с одной стороны, как эфиры нуклеозидов (фосфаты), а с другой – как кислоты (в связи с наличием остатка фосфорной кислоты).

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_002.jpeg

За счет фосфатного остатка нуклеотиды проявляют свойства двухосновной кислоты и в физиологических условиях при рН ~7 находятся в полностью ионизированном состоянии.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_004.png

Для нуклеотидов используют два вида названий. Одно включает наименование нуклеозида с указанием положения в нем фосфатного остатка, например, аденозин-3′-фосфат, уридин-5′-фосфат; другое строится с добавлением сочетания ловая кислота к названию остатка пиримидинового основания, например, 5′-уридиловая кислота, или пуринового основания, например 3′-адениловая кислота.

Используя принятый для нуклеозидов однобуквенный код, 5′-фосфаты записывают с добавлением латинской буквы «р» перед символом нуклеозида, 3′-фосфаты – после символа нуклеозида. Аденозин-5′-фосфат обозначается рА, аденозин-3′-фосфат – Ар и т. п. Эти сокращенные обозначения используют для записи последовательности нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. По отношению к свободным нуклеотидам в биохимической литера-

туре широко используют их названия как монофосфатов с отражением этого признака в сокращенном коде, например АМР (или АМФ) для аденозин-5′-фосфата и т. д.

Важнейшие нуклеотиды, входящие в состав нуклеиновых кислот

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_009.jpeg

 

Циклофосфаты. К ним относятся нуклеотиды, у которых одна молекула фосфорной кислоты этерифицирует одновременно две гидроксильные группы углеводного остатка. Практически во всех клетках присутствуют два нуклеозидциклофосфата – аденозин-3′,5′- циклофосфат (cAMP) и гуанозин-3′,5′-циклофосфат (cGMP).

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_012.jpeg

 

СТРУКТУРА НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ

Первичная структура

В полинуклеотидных цепях нуклеотидные звенья связаны через фосфатную группу. Фосфатная группа образует две сложноэфирные связи: с С-3′ предыдущего и с С-5′ последующего нуклеотидных звеньев. Каркас цепи состоит из чередующихся пентозных и фосфатных остатков, а гетероциклические основания являются «боковыми» группами, присоединенными к пентозным остаткам. Нуклеотид со свободной 5′-ОН группой называют 5′-концевым, а нуклеотид со свободной З‘-ОН группой – З’-концевым.

Участка цепи ДНК, включающего четыре нуклеиновых основания. Легко представить, какое множество сочетаний можно получить путем варьирования последовательности четырех нуклеотидных остатков. Принцип построения цепи РНК такой же, как и у ДНК, с двумя исключениями: пентозным остатком в РНК служит D-рибоза, а в наборе гетероциклических оснований используется не тимин, а урацил.

Первичная структура нуклеиновых кислот определяется последовательностью нуклеотидных звеньев, связанных ковалентными связями в непрерывную цепь полинуклеотида.

Для удобства записи первичной структуры существует несколько способов сокращений. Один из них заключается в использовании ранее приведенных сокращенных названий нуклеозидов.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_013.jpeg

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_015.jpeg

Важной характеристикой нуклеиновых кислот служит нуклеотидный состав, т. е. набор и количественное отношение нуклеотидных компонентов. Нуклеотидный состав устанавливают, как правило, путем исследования продуктов гидролитического расщепления нуклеиновых кислот.

ДНК и РНК различаются поведением в условиях щелочного и кислотного гидролиза. ДНК устойчивы к гидролизу в щелочной среде. РНК легко гидролизуются в мягких условиях в щелочной среде до нуклеотидов, которые, в свою очередь, способны в щелочной среде отщеплять остаток фосфорной кислоты с образованием нуклеозидов. Нуклеозиды в кислой среде гидролизуются до гетероциклических оснований и углеводов.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_005.png

 

Вторичная структура ДНК

Под вторичной структурой понимают пространственную организацию полинуклеотидной цепи. Согласно модели Уотсона-Крика молекула ДНК состоит из двух полинуклеотидных цепей, правозакрученных вокруг общей оси с образованием двойной спирали. Пуриновые и пиримидиновые основания направлены внутрь спирали. Между пуриновым основанием одной цепи и пиримидиновым основанием другой цепи возникают водородные связи. Эти основа- ния составляют комплементарные пары.

Водородные связи образуются между аминогруппой одного основания и карбонильной группой другого -NH…O=C-, а также между амидным и иминным атомами азота -NH…N-Например, как показано ниже, между аденином и тимином образуются две водородные связи, и эти основания составляют комплементарную пару, т. е. аденину в одной цепи будет соответствовать тимин в другой цепи. Другую пару комплементарных оснований составляют гуанин и цитозин, между которыми возникают три водородные связи.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_010.jpeg

Водородные связи между комплементарными основаниями – один из видов взаимодействий, стабилизирующих двойную спираль. Две цепи ДНК, образующие двойную спираль, не идентичны, но комплементарны между собой. Это означает, что первичная структура, т. е. нуклеотидная последовательность, одной цепи предопределяет первичную структуру второй цепи.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_003.jpeg

 

Нуклеотидные коферменты

Нуклеотиды имеют большое значение не только как строительный материал для нуклеиновых кислот. Они участвуют в биохимических процессах и особенно важны в роли коферментов, т. е. веществ, тесно связанных с ферментами и необходимых для проявления ими ферментативной активности.

Нуклеозидполифосфаты

Во всех тканях организма содержатся моно-, ди– и трифосфаты нуклеозидов. Особенно широко известны аденинсодержащие нук леотиды – аденозин-5′-фосфат (АМР), аденозин-5′-дифосфат (ADP) и аденозин-5′-трифосфат (ATP) (для этих соединений наряду с приведенными сокращенными обозначениями латинскими буквами в отечественной литературе используют сокращения соответствующих русских названий – АМФ, АДФ, АТФ).

Нуклеотиды, фосфорилированные в разной степени, способны к взаимопревращениям путем наращивания или отщепления фос фатных групп. Дифосфатная группа содержит одну, а трифосфатная – две ангидридные связи, называемые макроэргическими, поскольку они обладают большим запасом энергии. Необходимые для образования такой связи энергетические затраты восполняются за счет энергии, выделяемой в процессе метаболизма углеводов. При расщеплении макроэргической связи Р (обозначаемой волнистой линией) выделяется ~32 кДж/моль. С этим связана важнейшая роль АТФ как «поставщика» энергии во всех живых клетках.

В показанных ниже взаимопревращениях АМФ, АДФ и АТФ формулы этих соединений соответствуют их неионизированному состоянию. В физиологических условиях при рН ~7 фосфатные группы почти полностью ионизированы, поэтому в биохимической литературе эти и любые другие нуклеотиды записывают соответственно в виде анионов.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_007.jpeg

 

Нуклеозидполифосфаты в биохимических процессах. С участием АТФ и АДФ в организме осуществляется важнейший биохимический процесс – перенос фосфатных групп. Например, образование сложных эфиров (фосфатов) – типичная реакция в метаболизме углеводов. Все стадии гликолиза (превращения глюкозы в пируват) осуществляются только в фосфатной форме. Получение фосфатов гидроксилсодержа щих соединений можно представить в виде общей схемы.

 

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4.png

Так, галактоза, образующаяся при расщеплении лактозы, на начальной стадии метаболического превращения в глюкозу взаимодействует с АТФ с образованием монофосфата.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_008.jpeg

 

Никотинамиднуклеотиды

Наиболее важными представителями этой группы соединений являются никотинамидадениндинуклеотид (NAD, или в русской литературе НАД) и его фосфат (NADP, или НАДФ). Эти соединения выполняют важную роль коферментов в осуществлении многих

окислительно-восстановительных реакций. В соответствии с этим они могут существовать как в окисленной (НАД+, НАДФ+), так и восстановленной (НАДН, НАДФН) форме.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_011.jpeg

Структурным фрагментом НАД+ и НАДФ+ является никотинамидный остаток в виде пиридиниевого катиона. В составе НАДН и НАДФН этот фрагмент превращается в остаток 1,4-дигидропиридина.

В ходе биологического дегидрирования субстрат теряет два атома водорода, т. е. два протона и два электрона (2Н+, 2е) или протон и гидрид-ион (Н+ и Н). Кофермент НАД+ обычно рассматривается как акцептор гидрид-иона Н (хотя окончательно не установлено, происходит ли перенос атома водорода к этому коферменту одновременно с переносом электрона или эти процессы протекают раздельно).

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_003.png

В результате восстановления путем присоединения гидрид-иона к НАД+ пиридиниевое кольцо переходит в 1,4-дигидропиридиновый фрагмент. Этот процесс обратим.

Описание: Описание: http://vmede.org/sait/content/Bioorganicheskaja_himija_tykavkina_2010/15_files/mb4_006.jpeg

В реакции окисления ароматический пиридиниевый цикл переходит в неароматический 1,4-дигидропиридиновый цикл. В связи с потерей ароматичности возрастает энергия НАДН по сравнению с НАД+. Таким способом НАДН запасает энергию, которая затем расходуется в других биохимических процессах, требующих энергетических затрат.

Типичными примерами биохимических реакций с участием НАД+ служат окисление спиртовых групп в альдегидные, а с участием НАДН – восстановление карбонильных групп в спиртовые.

Нуклеиновые кислоты – это высокомолекулярные соединения, состоящие из мономерных единиц – нуклеотидов, и поэтому их также называют полинуклеотидами

Каждый нуклеотид содержит три различных компонента: азотистое основание (пуриновых или пиримидиновых) пентозу и фосфорную кислоту. Описание: Описание: Описание: Описание: метаболізм нуклеопротеїнів

Рис. 1. Структура аденозинмононуклеотида

Главные азотистые основания компоненты нуклеиновых кислот: пуриновые аденин (А) и гуанин ), пиримидиновые урацил), цитозин (Ц), тимин (Т) (рис. 2).

Рис. 2. Стоение азотистых оснований.

 

Кроме указанных выше основных пяти азотистых оснований ( двух пуриновых и трех пиримидиновых ) , в состав некоторых нуклеиновых кислот входят в относительно незначительных количествах дополнительные ( минорные ) азотистые основания и соответствующие им минорные нуклеотиды. Наибольшее количество минорных нуклеотидов встречается в молекулах транспортных РНК ( тРНК) – до 5 % общего нуклеотидного состава. К минорным нуклеотидам относятся метилированные производные обычных азотистых оснований, в частности, 1 – метиладенин, 2 – метиладенин, 6- диметиладенин, 1 – метилгуанин, 7- метилгуанин, 1 – метилурацил, 5- оксиметилурацил, 3 – метилцитозин т.п. ДНК человека содержат значительное количество 5- метилцитозину, информационные РНК – N – метилированных производные аденина и гуанина. Нуклеотидом необычной структуры , входящей в состав тРНК , является псевдоуридин – нуклеотид ( рис. 3 ), в котором рибоза присоединена к урацила в 5 – м положении , то есть не азот- карбоновым , а карбон- карбоновым связью. Такие основы в молекулах нуклеиновых килоты во многих случаях являются специфическими сигналами, которые играют важную роль в реализации генетической информации или обеспечении ее хранения. Биологические функции минорных нуклеотидов до конца не выяснены.

Рис. 3. Строение псевдоуридина.

Нуклеотиды в составе ДНК содержат углевод D-2дезоксирибозу, а в РНК Dрибозу (рис. 4). Обе пентозы находятся в Р-фуранозных форме:

Рис. 4. Строение пентоз: 1 – Dрибоза, 2 D-2дезоксирибоза.

Атомы углерода в пентозах нумеруются цифрами со штрихом, чтобы отличить их от атомов углерода в азотистых основаниях. При соединении рибозы или дезоксирибозы с азотистой основой образуется нуклеозид (рис. 5)

Рис. 5. Структура нуклеозида.

Связь между пентозой и азотистой основой идет от первого атома углерода пентозы к первому атому азота пиримидина или девятого атома азота пурина. Связь называется гликозидной. Нуклеотиды – это фосфорные эфиры нуклеозидов. Связь образуется за счет взаимодействия фосфата с гидроксилом в положении С-5 ‘пентозы. При гидролизе нуклеиновых кислот могут образовываться и нуклеозид-3′-монофосфата (рис. 6).  

Рис. 6. Структура нуклеозид-3′-монофосфата.

В зависимости от строения пентозы, нуклеотиды делятся на рибонуклеотиды и дезоксирибонуклеотидов. Наличие остатков фосфорной кислоты в составе нуклеотидов придает им кислотных влативостей, поэтому их считают кислотами, как и полимеры – нуклеиновые кислоты.

Далее приведена номенклатура нуклеозидов и нуклеотидов и формулы четырех главных дезоксирибонуклеотидов (структурных единиц ДНК) (рис. 7) и четырех главных рибонуклеотидов (структурных единиц РНК) (рис. 8).

Рис. 7. Строение дезоксирибонуклеотидов

 

Описание: Описание: Описание: Описание: C:\Users\5\Desktop\Презентация1.jpg

Описание: Описание: Описание: Описание: C:\Users\5\Desktop\Презентация1.jpg

Рис. 8. Строение рибонуклеотидов.

В организме, кроме нуклеозидмонофосфатов, находятся нуклеозиддифосфаты и нуклеозидтрифосфат. В синтезе нуклеиновых кислот участвуют именно нуклеозидтрифосфат (рис. 9).

Описание: Описание: Описание: Описание: Описание: Описание: bioenergetika-celi-na-prepodavatelq-_html_65eb6f61

Рис. 9. Строение аденозинтрифосфата.

Система АТФАДФАМФ играет особую роль в биоэнергетике, во всех живых организмах АТФ выступает как депо для хранения и переноса энергии. Аналогично АТФ, другие нуклеозидтрифосфат также содержат два высокоэнергетические связи между фосфатными остатками и используются в обмене веществ.

Например, ЦТФ имеет отношение к биосинтезу фосфолипидов. УТФ используется для синтеза и взаимопревращений различных углеводов, ГТФ необходим для синтеза белков. В состав коферментов НАД, НАДФ, ФАД, КоА, ФАФС входят адениловые нуклеотиды. Отдельную группу составляют циклические нуклеотиды, в которых фосфатный остаток образует сложноэфирные связи с 3′и 5′гидроксильными группами рибозы (рис. 10):

Рис. 10. Строение циклических нуклеотидов.

Циклические аденозинмонофосфат (цАМФ) и гуанозинмонофосфат (цГМФ) играют очень важную роль в обмене веществ, через них реализуется регуляторная роль ряда гормонов. цАМФ и цГМФ образуются из АТФ и ГТФ под действием ферментов аденилатциклазы и гуанилатциклазы.

Отщепление пирофосфата от нуклеозидтрифосфат приводит к замыканию шестичленного кольца. При расщеплении циклических нуклеотидов под действием фосфодиэстеразы образуются соответствующие нециклические нуклеотиды нуклеозид-5′-монофосфата.

Нуклеопротеиды

Нуклеопротеиды – сложные белки, комплексы нуклеиновых кислот с белками. В зависимости от типа нуклеиновой кислоты, нуклеопротеиды делятся на дезоксирибонуклеопротеины и рибонуклеопротеины. Устойчивость нуклеопротеинових комплексов обеспечивается ковалентным взаимодействием. Примером специфического взаимодействия могут служить нуклеопротеиды комплексы рРНК – субъединицы рибосом; неспецифическая электростатическое взаимодействие характерно для хромосомных комплексов ДНК – хроматина с гистонами и комплексов ДНК-протамины головок сперматозоидов некоторых животных. Нуклеопротеиды диссоциируют на белки и нуклеиновые кислоты при действии агентов, разрушающих или ослабляют Нековалентные связи: 1) повышенные концентрации солей или мочевины, увеличивающие ионную силу раствора; 2) ионогенные поверхностно-активные вещества; 3) некоторые полярные органические соединения (формамид и диметилформамид, фенол и др.). При образовании нуклеопротеинов происходят существенные конформационные изменения нуклеиновых кислот и, в некоторых случаях, белков, образующих нуклеопротеиновий комплекс. Эти изменения существенные в случае образования дезоксирибонуклеопротеїнів. В отличие от одноцепочечной РНК, способной образовывать вторичные и третичные структуры за счет антипараллельная комплементарного спаривания смежных отрезков цепи, двухцепочечная ДНК такой возможности не имеет, по сравнению с компактными глобулами РНК. Однако взаимодействие ДНК с белками (гистонами и протамин) за счет электростатического взаимодействия приводит к образованию значительно плотнее упакованных нуклеопротеинових комплексов – хроматина, обеспечивает компактное хранение ДНК и, соответственно, наследственной информации в составе хромосом эукариот. С другой стороны, большая конформационная подвижность РНК и ее каталитические свойства связаны с большим разнообразием рибонуклеопротеинив, выполняющих различные функции.

 

Дезоксирибонуклеопротеины

Хроматин – комплекс ДНК с гистонами в клетках эукариот. За счет электростатического взаимодействия нить ДНК осуществляет двойной оборот вокруг октамера гистонного комплекса H2a, H2b, H3 и H4, образуя нуклеосомы, соединенные нитью ДНК. При присоединении к комплексу гистона H1 шесть нуклеосом образуют кольцеобразный комплекс, в результате происходит конденсация хроматина с образованием фибриллярные структуры, которая далее при присоединении топоизомеразы II и ряда вспомогательных белков способна конденсироваться в гетерохроматине. ДНК, связанная в таком нуклеопротеиновому комплексе, НЕ транскрибируется. Отдельным важным классом дезоксирибонуклеопротеїнів являются вирусные нуклеопротеиды.

Рибонуклеопротеины

В клетках в основном содержатся следующие типы рибонуклеопротеинов (ГНП): 1) нуклеопротеиды комплексы рибосомных РНП (рРНП) – субъединицы рибосом – органелл, на которых происходит трансляция мРНК. Рибосомы являются агрегатами с двух разных рРНП-субъединиц. 2) Малые ядерные рибонуклеопротеины (мяРНП) – нуклеопротеиды комплексы малых ядерных РНК. 3) нуклеопротеиды комплексы мРНК – матричные рибонуклеопротеины (МРНП).

Переваривание нуклеопротеинов и всасывание продуктов их распада осуществляются в пищеварительном тракте. Под влиянием ферментов желудка, частично соляной кислоты, нуклеопротеины пищи распадаются на полипептиды и нуклеиновые кислоты; первые в кишечнике подвергаются гидролитическому расщеплению до свободных аминокислот. Распад нуклеиновых кислот происходит в тонкой кишке в основном гидролитическим путем под действием ДНК- и РНКазы панкреатического сока. Продуктами реакции при действии РНКазы являются пуриновые и пи-римидиновые мононуклеотиды, смесь ди и тринуклеотидов и резистентные к действию РНКазы олигонуклеотиды. В результате действия ДНКазы образуются в основном динуклеотиды, олигонуклеотиды и небольшое количество мононуклеотидов. Полный гидролиз нуклеиновых кислот до стадии мононуклеотидов осуществляется, очевидно, другими, менее изученными ферментами (фосфодиэстеразами) слизистой оболочки кишечника. В отношении дальнейшей судьбы мононуклеотидов существует два предположения. Считают, что мононуклеотиды в кишечнике под действием неспецифических фосфатаз (кислой и щелочной), которые гидролизируют фосфоэфирную связь мононуклеотида («нуклеотидазное» действие), расщепляются с образованием нуклеозидов и фосфорной кислоты и в таком виде всасываются. Согласно второму предположению, мононуклеотиды всасываются, а распад их происходит в клетках слизистой оболочки кишечника. Имеются также доказательства существования в стенке кишечника нуклеотидаз, катализирующих гидролитический распад мононуклеотидов. Дальнейший распад образовавшихся нуклеозидов осуществляется внутри клеток слизистой оболочки преимущественно фосфоролитическим, а не гидролитическим путем. Всасываются преимущественно нуклеозиды, и в таком виде часть азотистых оснований может быть использована для синтеза нуклеиновых кислот организма. Если происходит дальнейший распад нуклеозидов до свободных пуриновых и пиримидиновых оснований, то гуанин не используется для синтетических целей. Другие основания, как показывают опыты с меченными по азоту аденином и урацилом, в тканях могут включаться в состав нуклеиновых кислот. Однако экспериментальные данные свидетельствуют, что биосинтез азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот органов и тканей, протекает преимущественно, если не целиком, de novo из низкомолекулярных азотистых и безазотистых предшественников. Таким образом, синтез нуклеиновых кислот, мономерными единицами которых являются мононуклеотиды, будет определяться скоростью синтеза пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов; синтез последних в свою очередь зависит от наличия всех составляющих из трех компонентов. Источником рибозы и дезоксирибозы служат продукты превращения глюкозы в пентозофосфатном цикле. Пока не получены доказательства существенной роли пищевых пентоз в синтезе нуклеиновых кислот. Фосфорная кислота также не является лимитирующим фактором, поскольку она поступает в достаточном количестве с пищей. Следовательно, биосинтез нуклеиновых кислот начинается с синтеза азотистых оснований (точнее, мономерных молекул – мононуклеотидов).

Пищевые нуклеопротеины, попадая в организм человека, в желудке отщепляют белковый компонент и денатурируют под действием HCl желудочного сока.

 

Далее полинуклеотидная часть этих молекул гидролизуется в кишечнике до мононуклеотидов.

В расщеплении нуклеиновых кислот принимают участие ДНК-азы и РНК-азы панкреатического сока, которые, будучи эндонуклеазами, гидролизуют макромолекулы до олигонуклеотидов. Последние под действием фосфодиэстераз панкреатической железы расщепляются до смеси 3′- и 5′-мононуклеотидов. Нуклеотидазы и неспецифические фосфатазы гидролитически отщепляют фосфатный остаток нуклеотидов и превращают их в нуклеозиды, которые либо всасываются клетками тонкого кишечника, либо расщепляются нуклеозидфосфорилазами кишечника с образованием рибозоили дезоксирибозо-1-фосфата, пуриновых и пиримидиновых оснований.

Пищевые пурины и пиримидины не являются незаменимыми пищевыми факторами и очень мало используются для синтеза нуклеиновых кислот тканей. В энтероцитах обнаружена высокая активность ксантиноксидазыфермента, который большую часть пуринов, поступающих в клетки, превращает в мочевую кислоту, удаляющуюся с мочой. Пиримидиновые основания, не успевшие поступить в энтероциты, под действием микрофлоры кишечника расщепляются до NH3, CO2, β-аланина и β-аминоизобутирата.

В различных клетках организма синтезируется до 90% пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов из простых предшественников de novo.

Введённые в кровь азотистые основания и нуклеозиды, а также основания и нуклеозиды, образующиеся в результате внутриклеточного разрушения нуклеиновых кислот, в небольшом количестве могут использоваться для повторного синтеза нуклеотидов по так называемым «запасным» путям.

 

Синтез пуриновых нуклеотидов

В 40-50-х годах ХХ столетия опытами с мечеными изотопами удалось выяснить происхождение атомов пуринового ядра при синтезе пуринов de novo. Было установлено, что в формировании кольца принимают участие аминокислоты

Асп, Гли, Глн, СО2 и два одноуглеродных производных тетрагидрофолата: метенил-Н4-фолат и формил-Н4-фолат. Этим способом образуется основное количество пуриновых нуклеотидов, тогда как нуклеотиды, синтезирующиеся за счёт повторного использования азотистых оснований или нуклеозидов, составляют не более 10-20% общего фонда этих соединений.

 

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *

Приєднуйся до нас!
Підписатись на новини:
Наші соц мережі